Историјат Музеја у Брчко дистрикту датира од 1981. године. године, када се појавила идеја о формирању прве археолошке изложбе у оквиру Галерије „Ризах Штетић“. Идеја је реализована у децембру 1982. године. године, а отворена је и прва изложба „Археолошки налази на подручју Брчког и околине“. Недуго затим, у априлу 1986. У 2008. години Центар за културу и образовање повратника Радничког универзитета РЈ „Перо Ћускић“ отвара сталну поставку под називом „Археолошко-етнографска прошлост Брчког и околине“. Ова врста музејске делатности деловала је до деведесетих година прошлог века. века.

Након формирања Брчко дистрикта није било тенденције отварања нових музејских просторија. Материјал, који је био саставни дио инсталације из 80-их и 90-их година, остао је запечаћен у просторијама Вијећнице у Брчком, а потом и у згради Шипада. Током 2017 Етно-археолошка збирка Музеј је основан у оквиру Одељења за привредни развој, спорт и културу Пододељења за спорт, културу и туризам.

Етно-археолошка збирка Музеј се налази у згради „Шипада“ и тренутно ради у оквиру Владиног одељења за туризам, културу и спорт. Током 2018 Отворена је прва привремена поставка под називом „Од семена до платна” и званично је за посетиоце обележен почетак рада Музеја. Током године вршено је рекогносцирање терена, набавка материјала од грађана, попис старе и нове грађе, као и конзерваторско-рестаураторски радови. У фебруару 2019 У Музеју Брчко дистрикта одржани су Дани кинеске културе, а изложба је била отворена за посјетиоце мјесец дана. Током летњих месеци у Музеју су били изложени експонати у оквиру гостујуће изложбе „Немањићи – рађање краљевине“, која је привукла велики број заинтересованих грађана. Недуго затим, Музеј је пружио прилику да постави Изложбу „Нови живот старог храста“ аутора Иве Јелушића. Мештани су имали прилику да виде реплике керамичких здела костољске културе од ебановине.

Током јула 2021 У Музеју Брчко дистрикта отворена је прва природњачка изложба. Радило се о природњачкој изложби везаној за фосиле и скелетне остатке изумрлих животиња које су живеле у леденом добу. У оквиру Ноћи музеја 2022. Музеј је 2008. године отворио етнолошку поставку под називом „Од семена до софре“. Изложба је изазвала велико интересовање основних и средњих школа са подручја Брчког. Изложба је тренутно отворена у музеју, а посетиоци имају прилику да је посете сваког радног дана.

Поред актуелне изложбе, Музеј обавља и друге активности. Међу њима издвајамо радионице за децу, организоване за Ноћ музеја, Летњу школу археологије итд. Поред тога, Музеј је током марта месеца реализовао пројекат „Археологија у служби туризма“ заједно са ученицима Економске школе смера Туристички техничар.

Поред свих наведених активности, Музеј обавља и послове на припреми сталне поставке, која обухвата набавку и припрему грађе, рекогносцирање терена и регистрацију нових локација. Поред тога, у оквиру својих активности организује и промоцију научних публикација из области историје и археологије.